PAUP（windows版本）构建NJ树时用什么命令？
所属分类：新闻资讯 点击次数：6 发布日期：2026-04-20
大家好，这里是老上光显微镜知识课堂，在这里你可以学到所有关于显微镜知识，好的，请看下面文章：原标题：【求助/交流】求助PAUP（windows版本）构建NJ树时的输入命令的问题
Zui近用PAUP构建了NJ树，因为对这方面不太懂，Zui后发现输入的命令可能有问题，分支长度没有区别，并且substitution/site值也不对，别人文献里基本都是0.01，而我的确是10，我用的命令见下,求高人指导。
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Set criterion=distance
dset distance=hky85
Outgroup FJ883747
NJ
Bootstrap nreps=1000 search=nj
savetrees file=N.tre brlens=yes savebootp=both from=1 to=2
再输入NJ后可以看见树的分支长度是不一样的，但用bootstrap评估完后就一样了，是不是我应该更改什么命令呢？求解答
用MEGA？
用PAUP，mega的说明书挺多，但paup的介绍比较少
那就用MEGA呗。。。比较快。。
文章已经投了，因为树的形状现在回修，没法再改用别的软件作树了
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