微生物群体中基因氯盐酸降解实验显微镜
所属分类:新闻资讯 点击次数:12 发布日期:2026-04-20
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微生物群体中基因氯盐酸降解实验显微镜 如果对特定代谢基因表达或它的基因产物感兴趣,可以设计特定探针来检测它。例如,PCR设计引物靶定古菌amoA(基因编码氨单加氧酶0【亚基)揭示了其广泛存在于大多数海水及沉淀物中的氨氧化菌,暗示了这些生物在地球氮循环上起着重要作用(Francis等,2005)。另一个例子是用PCR设计引物靶定arrA基因,对于大多数砷酸盐呼吸细菌,它通常编码一个砷酸盐呼吸降解酶的亚基,用来检测该基因在含砷培养基中的表达(Malasarn等,2004)。在这些研究中,大量mRNA从培养基提取出来并在PCR检测前反转录为DNA。借助于实时定量PCR(q—PCR)对表达基因进行定量(Walker,2002)。这样的方法可以用于定量海水环境中的蓝绿菌(Johnson等,2006)。 PCR方法需要强调的一点是,基因的翻译后控制可能影响感兴趣基因产物的丰度(组成成分的产生或消失);因此,对一个特定环境中DNA或RNA序列的检测不能证明其产物在环境中的存在。对此更好的检测是用抗体反向靶定感兴趣的蛋白。有个已经用于氯盐酸降解领域的例子,氯盐酸歧化酶(CD)(0’Connor和Coates)在环境下氯盐酸降解细菌中是高度保守的,因此,CD的出现是这个过程特异性探针的良好靶标。如果要了解微生物群体中基因/蛋白表达的时序性,可以用FISH技术,附加说明是
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