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微生物群体中基因氯盐酸降解实验显微镜
所属分类：显微镜百科 点击次数：171 发布日期：2022-06-20
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微生物群体中基因氯盐酸降解实验显微镜 如果对特定代谢基因表达或它的基因产物感兴趣，可以设计特定探针来检测它。例如，PCR设计引物靶定古菌amoA(基因编码氨单加氧酶0【亚基)揭示了其广泛存在于大多数海水及沉淀物中的氨氧化菌，暗示了这些生物在地球氮循环上起着重要作用(Francis等，2005)。另一个例子是用PCR设计引物靶定arrA基因，对于大多数砷酸盐呼吸细菌，它通常编码一个砷酸盐呼吸降解酶的亚基，用来检测该基因在含砷培养基中的表达(Malasarn等，2004)。在这些研究中，大量mRNA从培养基提取出来并在PCR检测前反转录为DNA。借助于实时定量PCR(q—PCR)对表达基因进行定量(Walker，2002)。这样的方法可以用于定量海水环境中的蓝绿菌(Johnson等，2006)。 PCR方法需要强调的一点是，基因的翻译后控制可能影响感兴趣基因产物的丰度(组成成分的产生或消失)；因此，对一个特定环境中DNA或RNA序列的检测不能证明其产物在环境中的存在。对此更好的检测是用抗体反向靶定感兴趣的蛋白。有个已经用于氯盐酸降解领域的例子，氯盐酸歧化酶(CD)(0’Connor和Coates)在环境下氯盐酸降解细菌中是高度保守的，因此，CD的出现是这个过程特异性探针的良好靶标。如果要了解微生物群体中基因／蛋白表达的时序性，可以用FISH技术，附加说明是
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