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于筛选微生物种群-检测微克样本量同位素
所属分类:显微镜百科 点击次数:100 发布日期:2022-06-20
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于筛选微生物种群-检测微克样本量同位素 SIP的一个潜在缺陷是与13C结合能力太强(大于50%),使其对生长慢的生物(或用多培养基的生物)检测不敏感。一项新的允许检测微克样本量的同位素SwiM技术已经被开发出来(Sessions等,2005)可能对这个问题有用。SwiM技术已经被用于分析rRNA,特异性捕获靶特异性多态群(Pearson等,2008)和整个细胞流式细胞计数分类(例如,荧光强度的细胞分类[FACS])(Eek等,2006)。这种方法对自然丰富”C和人造富含13C示踪的基质均适用。简要来说,CO:被氦气流载到同位素比率较大的分光器(IRMS)来确定13c/12c的比率。FACS—SwiM技术虽然很敏感,在使用时的一个不足是很难分离和积累足够量的生物团(10 7细菌细胞或104真核细胞,Eek等,2006)来检测,特别对于不是自发荧光细胞。要检测这样的细胞,必须要用外源放大的荧光光子(例如那些用于CARD—FISH反应的)检测器,但是这样细胞中会出现太多外源碳干扰rc的值。在没有加入外源碳条件下,对完整细胞荧光标记的发展使FACS—SwiM技术的应用更加广泛。 另一项用于稳定同位素鉴定微生物的方法是将利用放射性同位素标定反应基质。这在早些的单细胞中已经描述过了(FISH—MAR),但是微阵列同样能用于筛选微生物种群。在同
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